21 апреля 2013 — года сотрудниками прокуратуры, Министерства юстиции и налоговой службы была начата комплексная проверка деятельности организации[14] с целью установить источники финансирования. В этот же день глава «Мемориала» А. Б. Рогинский сделал заявление, что отказываться от иностранного финансирования организация не собирается, однако проходить регистрацию не станет[15].
30 апреля 2013 — по результатам проверки Прокуратурой России было выдано предписание «Мемориалу» зарегистрироваться в качестве иностранного агента[16].
23 мая 2014 — Замоскворецкий суд признал, что правозащитный центр занимается политической деятельностью за счёт иностранного финансирования и обязал «Мемориал» зарегистрироваться в качестве иностранного агента[12].
12 сентября 2014 — в ходе рассмотрения апелляции было установлено соответствие деятельности правозащитного центра «Мемориал» признакам деятельности иностранного агента, и апелляционная коллегия Московского городского суда отклонила жалобу «Мемориала» и признала решение Замоскворецкого суда о признании центра «Мемориал» иностранным агентом законным и обоснованным[17].
10 октября 2014 — минюст обратился в Верховный суд с иском о ликвидации общественной организации «Мемориал».[