разный принцип действия и дальность полета. Баллистическая всегда выходит на орбиту(причем наши Ярсы летят в "коридоре" повыше, чем летают истребители, но пониже спутников), сбить ее проще всего только на взлете, поэтому ракета активно маневрирует на взлете, дальность полета - межконтинентальная, зачастую несет несколько ядерных боеголовок. Если верить написанному один ЯРС способен уничтожить до 6 городов размером с Лос-Анджелес. Это оружие возмездия. Крылатые летят как можно ближе к поверхности, "тише травы, ниже радаров". Опять же если верить написанному, то время полёта калининградского Искандера до Варшавы - 2 минуты 20 секунд. Т.е. это оружие наступательное, основная задача расчистить путь авиации от ПВО, уничтожение крупного скопления живой силы(разные модификации боеголовок). Дальность полета того же искандера официально 500км