8 липня Трубецькой відіслав 30 000 відбірної московської кінноти на чолі з боярином Семеном Пожарським наздогнати Виговського. 9 липня загін Виговського атакував табір Пожарського і знищив майже всі 30 000 війська.

Російський історик XIX сторіччя С. М. Соловйов так описав реакцію царя на сумну звістку:

Цвіт московської кінноти, що відбув щасливі походи 1654 і 1655 років, загинув за один день, і вже ніколи після того цар московський не був у змозі вивести в поле такого блискучого війська. У жалібній одежі вийшов цар Олексій Михайлович до народу й жах охопив Москву. Удар був тим важчий, що був несподіваним.

Конотопська битва залишалася довгий час ледве не забороненою темою в російській та особливо радянській історіографії.355-річчя перемоги армії гетьмана Виговського над московським військом!СЛАВА УКРАИНЕ!СМЕРТЬ ВРАГАМ!ЭТО ОПОЛЧЕНЦЫ МОЧАТ МИРНОЕ НАСЕЛЕНИЕ ПО ЗАКАЗУ ХУТИН-ПУЙ-ТВ!