Если эти три предмета не идут в аттестат, то почему бы и не продолжать ставить оценки? С другой стороны оценивать самовыражение в рисовании или музыке - в жестких оценках - это очень сложно. Это не математика.
А физкультура должна быть просто развитием привычки к физической составляющей активности.
Иначе получаются анекдотические ситуации: на моем курсе в МГУ (70-80е) за все пять лет по неуспеваемости был отчислен ОДИН человек. За незачет по физкультуре.